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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
纽约爱乐乐团举办第十二届中国新年音乐会******
中新社纽约1月31日电 (记者 王帆)当地时间1月31日，纽约爱乐乐团第十二届中国新年音乐会暨庆典在纽约林肯中心大卫·葛芬音乐厅举行。这是这支著名乐团连续第十二年举办中国新年音乐会。
图为中国著名指挥家余隆在音乐会上。 中新社记者 王帆 摄当晚，能容纳2200名观众的大卫·葛芬音乐厅吴蔡剧院(Wu Tsai Theater)几乎座无虚席。音乐会由著名指挥家余隆执棒，二胡演奏家陆轶文、小提琴家宁峰与纽约爱乐乐团担纲演奏。在作曲家李焕之的《春节序曲》中，音乐会拉开序幕。
图为小提琴家宁峰与纽约爱乐乐团演奏《西区故事》组曲。 中新社记者 王帆 摄随后，作曲家陈其钢为二胡和交响乐团改编的新版《悲喜同源》迎来美国首演。陆轶文作为中国音乐最高奖——金钟奖与文华奖的双金奖获得者，在演奏此作品时大胆使用两把二胡，将东方乐器的独特魅力发挥到极致。乐曲刚一结束，剧院内就响起热烈的掌声。
当晚的演出曲目还包括郭文景的《草原》、格里格的《索尔维格之歌》、伯恩斯坦的《西区故事》，以及返场时刘天华的《空山鸟语》和萨拉萨蒂的《纳瓦拉舞曲》。
图为二胡演奏家陆轶文与纽约爱乐乐团演奏新版《悲喜同源》。 中新社记者 王帆 摄其中，改编自百老汇经典音乐剧的《西区故事》组曲由著名小提琴家宁峰领衔演奏。宁峰曾获2005年迈克·希尔国际小提琴比赛(新西兰)第一名及2006年帕格尼尼国际小提琴比赛第一名。他以饱满的情感和超凡的技巧，用音乐把观众带到20世纪50年代，让他们感受发生在林肯中心一带移民社区的爱情故事。
图为音乐会现场。 中新社记者 王帆 摄“我在疫情前看过很多届爱乐乐团的中国新年音乐会，今年音乐会恢复线下举办，非常开心。”从新泽西州赶来现场的张女士对记者说，她最喜欢《西区故事》组曲，看华人小提琴家携手纽约爱乐乐团演奏，是一种很美妙的感觉。
纽约爱乐乐团首席执行官黛博拉·博达(Deborah Borda)表示，纽约是喜爱庆祝的城市，中国新年音乐会连续举办了十二年，让人们了解到很多有才华的音乐家，欣赏到多样文化。“我们非常高兴。祝大家新年快乐。”(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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